Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smyd1P97443 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms