Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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