Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga11P61622 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms