Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmoP56726 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmoP56726 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmoP56726 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmoP56726 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmoP56726 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmoP56726 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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