Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrlP54846 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrlP54846 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrlP54846 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrlP54846 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrlP54846 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrlP54846 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NrlP54846 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrlP54846 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrlP54846 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrlP54846 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms