Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PctpP53808 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PctpP53808 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PctpP53808 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PctpP53808 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PctpP53808 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PctpP53808 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PctpP53808 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PctpP53808 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PctpP53808 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PctpP53808 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PctpP53808 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PctpP53808 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PctpP53808 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PctpP53808 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PctpP53808 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PctpP53808 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms