Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAMP50895 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAMP50895 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAMP50895 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms