Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6aP50446 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms