Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cav1P49817 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cav1P49817 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cav1P49817 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cav1P49817 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms