Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms