Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt1P46096 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms