Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms