Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighmbp2P40694 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighmbp2P40694 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms