Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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