Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms