Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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