Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms