Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms