Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms