Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja1P23242 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja1P23242 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gja1P23242 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms