Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tap1P21958 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tap1P21958 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms