Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VimP20152 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VimP20152 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
VimP20152 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms