Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P20040 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P20040 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P20040 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P20040 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P20040 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P20040 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P20040 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P20040 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P20040 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P20040 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P20040 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P20040 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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