Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms