Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrgnP13609 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrgnP13609 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrgnP13609 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrgnP13609 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrgnP13609 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrgnP13609 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrgnP13609 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrgnP13609 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrgnP13609 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms