Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc8P09025 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc8P09025 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc8P09025 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc8P09025 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc8P09025 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc8P09025 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc8P09025 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc8P09025 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms