Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prm2P07978 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms