Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01653 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01653 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01653 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01653 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01653 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01653 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01653 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01653 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01653 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01653 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms