Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AurkcO88445 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms