Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms