Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms