Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms