Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copb2O55029 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms