Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DffaO54786 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffaO54786 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffaO54786 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DffaO54786 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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