Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms