Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Dgcr6O35347 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dgcr6O35347 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms