Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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