Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms