Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3424L7N298 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3424L7N298 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3424L7N298 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3424L7N298 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3424L7N298 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms