Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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