Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms