Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef1G3X9K3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms