Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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