Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms