Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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