Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms