Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms