Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan18E9PUD6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan18E9PUD6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms