Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms