Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30cD3YVI9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms